Sở Xây Dựng là cơ quan chuyên môn thuộc UBND tỉnh, thực hiện chức năng quản lý Nhà nước về xây dựng trên địa bàn tỉnh theo đúng đường lối, chính sách của Đảng, pháp luật của Nhà nước và những quy định của UBND tỉnh; chịu sự quản lý và chỉ đạo trực tiếp của UBND tỉnh, đồng thời chịu sự chỉ đạo và hướng dẫn về chuyên môn nghiệp vụ của Bộ Xây Dựng và các Bộ Ngành có liên quan khác.
I. Ban Giám đốc gồm: Giám đốc và 14 Phó Giám đốc (lộ trình đến năm 2030 bố trí đảm bảo số lượng Phó Giám đốc theo quy định)
a) Giám đốc Sở do Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh bổ nhiệm, chịu trách nhiệm trước Ủy ban nhân dân, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh và trước pháp luật về thực hiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn quản lý nhà nước về ngành, lĩnh vực ở địa phương và các công việc được Ủy ban nhân dân, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh phân công hoặc ủy quyền; không chuyển công việc thuộc nhiệm vụ, quyền hạn của mình lên Ủy ban nhân dân, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh. Giám đốc Sở có trách nhiệm báo cáo với Ủy ban nhân dân, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh; Bộ, cơ quan ngang bộ về tổ chức, hoạt động của cơ quan mình; báo cáo công tác trước Hội đồng nhân dân tỉnh khi có yêu cầu; cung cấp tài liệu cần thiết theo yêu cầu của Hội đồng nhân dân tỉnh; trả lời kiến nghị của cử tri, chất vấn của đại biểu Hội đồng nhân dân tỉnh về những vấn đề trong phạm vi ngành, lĩnh vực quản lý; phối hợp với các Giám đốc sở khác, người đứng đầu tổ chức chính trị - xã hội, các cơ quan có liên quan trong việc thực hiện nhiệm vụ của Sở.
b) Phó Giám đốc Sở do Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh bổ nhiệm theo đề nghị của Giám đốc Sở, thực hiện một hoặc một số nhiệm vụ cụ thể do Giám đốc Sở phân công, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở và trước pháp luật về thực hiện nhiệm vụ được phân công. Khi Giám đốc Sở vắng mặt, một Phó Giám đốc Sở được ủy quyền thay Giám đốc Sở điều hành các hoạt động của Sở. Phó Giám đốc Sở không kiêm nhiệm người đứng đầu tổ chức, đơn vị thuộc và trực thuộc Sở, trừ trường hợp pháp luật có quy định khác.
II. Các Phòng chuyên môn:
1. Văn phòng
2. Phòng Kế hoạch - Tài chính
3. Phòng Quy hoạch - Kiến trúc - Phát triển đô thị
4. Phòng Quản lý Nhà và thị trường bất động sản
5. Phòng Giám định xây dựng
6. Phòng Quản lý đầu tư xây dựng
7. Phòng Quản lý kết cấu hạ tầng
8. Phòng Quản lý vận tải và An toàn
III. Các Đơn vị trực thuộc:
1. Cảng vụ Đường thủy nội địa
2. Trung tâm Quản lý và bảo trì công trình xây dựng Vĩnh Long
3. Trung tâm Quản lý và Phát triển nhà
4. Bến xe khách Vĩnh Long
5. Ban Quản lý Bến xe khách Trà Vinh
6. Trung tâm Quản lý phà và bến xe Bến Tre
7. Trung tâm Thẩm định, kiểm định công trình giao thông vận tải Vĩnh Long
8. Trung tâm tư vấn và Kiểm định xây dựng Bến Tre
9. Trung tâm đào tạo Kỹ thuật nghiệp vụ giao thông vận tải Trà Vinh
10. Trung tâm Quy hoạch và Giám định xây dựng Trà Vinh
11. Trung tâm Xây dựng và giao thông Vĩnh Long
12. Ban Quản lý bảo trì công trình giao thông Bến Tre